Comprendere i requisiti dei campioni di DNA per i test genetici

Introduzione ai campioni di DNA

I campioni di DNA sono campioni di sangue o altri campioni biologici forniti da individui per l'analisi del DNA. Nel campo medico vengono utilizzati comunemente per diagnosticare disturbi genetici, come le malattie ereditarie. Vengono impiegati anche dalle forze dell'ordine per indagare su casi criminali attraverso il confronto dei campioni con le prove raccolte sulla scena del crimine, come sangue o capelli. Negli Stati Uniti, la raccolta, l'analisi e l'uso delle informazioni genetiche sono regolati dal Genetic Information Non-Discrimination Act (GINA).

Requisiti di massa del DNA

La massa totale di DNA richiesta comprende la massa per le riesaminazioni e la massa per la pipettatura, il processo di raccolta di una quantità misurata di fonte di DNA (come la saliva) da cui il DNA verrà estratto per l'analisi. Viene eseguito utilizzando uno strumento da laboratorio chiamato pipetta, progettato per raccogliere minuscoli volumi liquidi. Pertanto, la massa di DNA appropriata dipende dall'ambito delle attività del progetto. Ad esempio:

• Per il genotipaggio Illumina Infinium HD, è necessario raccogliere una massa di 200 nanogrammi (ng) per campione.
• Per il genotipaggio Illumina Golden Gate, è richiesta una massa di 250 ng per campione.

Requisiti di volume del DNA

Per l'analisi del DNA, il volume minimo richiesto per un'analisi di successo è di 5 microlitri (µl). Tuttavia, la raccolta di volumi di campione adeguati dipende dalla concentrazione e dalla massa richiesta per l'analisi. Per campioni altamente concentrati, in cui il volume richiesto è inferiore a 5 µl, il campione deve essere diluito fino a raggiungere 5 µl. Se il campione di DNA deve essere trasportato per lunghe distanze, il metodo migliore è trasportarlo come campione essiccato.

Intervallo di concentrazione del DNA

I campioni di DNA possono essere presentati come campioni umidi o secchi. La concentrazione dipende dal tipo di campione:

• Campioni umidi: La concentrazione minima per i test Uniplex e Sequenom iPLEX è 5 ng/µl, mentre per il genotipaggio Illumina è 50,0 ng/µl.
• I campioni di DNA dovrebbero essere il più concentrati possibile. Se la diluizione è necessaria, si deve utilizzare solo acqua.

Etichettatura del campione

Il campione raccolto deve essere etichettato con il nome del paziente e la data di nascita. Un modulo di richiesta deve essere compilato e firmato con il consenso del paziente, e il modulo insieme al campione di DNA deve essere inviato al laboratorio dove verrà effettuata l'analisi.

Requisiti per campioni e piastre di DNA

Quando si inviano campioni, devono essere utilizzate esclusivamente piastre a 96 pozzetti. Queste piastre devono essere sigillate completamente per evitare contaminazioni durante il trasporto. La massa, il volume e la concentrazione di tutti i campioni devono essere uniformi e sufficienti per consentire un'analisi di successo. Se uno di questi fattori varia, i campioni di DNA verranno disqualificati per l'analisi.